A AAO é a primeira Associação de Agricultura Orgânica do Brasil, fundada em 1989 por grandes nomes da agroecologia como Ana Primavesi, Adilson Paschoal, Sebastião Pinheiro, Shiro Miyasaka e seu primeiro presidente foi José Pedro Santiago. Através da Associação, a ciência agronômica voltada para a produção de alimentos saudáveis chegou a diversos produtores que atualmente vivem da agricultura orgânica e que através das feiras geram renda para suas famílias. O slogan “Orgânico para todos” sintetiza a missão da AAO de alcançar mais produtores e a população brasileira através do comércio justo e solidário. A AAO também foi a primeira ONG brasileira a criar normas de produção orgânica centradas na realidade local, contemplando os critérios básicos para os agricultores se credenciarem na Feira do Produtor Orgânico. Em 1989 foi cedido pela Secretaria de Agricultura e Abastecimento – SAA o espaço no Parque da Água Branca onde a AAO instalou sua sede, inaugurada em 27 de março de 1990.